神曲與建曲都是中藥，在原料、制作工藝、功效、應用、口感等方面存在一些區別。

1.原料：神曲是以面粉或麩皮為主要原料，加入青蒿、蒼耳、辣蓼等草藥的汁液混合后發酵制成；建曲則是由多種中藥，如紫蘇、荊芥、防風、羌活、厚樸、白術、木香、枳實等，加上面粉或麩皮混合后發酵而成。

2.制作工藝：神曲的制作相對較為簡單，主要是將原料混合后發酵；建曲的制作工藝較為復雜，需要將多種中藥進行合理配伍后再進行發酵。

3.功效：神曲具有消食和胃的功效，主要用于飲食積滯、消化不良等癥；建曲的功效除了消食和胃外，還具有解表化濕、理氣和中的作用，適用于感冒風寒、食積氣滯、胸悶腹脹等癥。

4.應用：神曲常用于食積不化、脘腹脹滿、不思飲食等病癥；建曲則更適用于既有食積又有外感風寒或氣滯等病癥的治療。

5.口感：神曲的味道相對較單一；建曲由于含有多種中藥，其味道更為復雜。

在使用神曲和建曲時，應根據具體病情和個體差異，在醫生的指導下合理選用，以達到最佳的治療效果。同時，無論是使用神曲還是建曲，都應注意適量，避免過量使用引起不良反應。