土茯苓和云苓茯苓在來源、性狀、功效、應用、禁忌等方面存在區別：

1.來源：土茯苓為百合科植物光葉菝葜的干燥根莖；茯苓為多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核。

2.性狀：土茯苓略呈圓柱形，表面黃棕色或灰褐色，凹凸不平，質堅硬；茯苓呈類球形、橢圓形或不規則塊狀，表面淡棕色或黑褐色，質堅實。

3.功效：土茯苓具有解毒、除濕、通利關節的作用；茯苓具有利水滲濕、健脾、寧心的功效。

4.應用：土茯苓常用于梅毒及汞中毒所致的肢體拘攣、筋骨疼痛，濕熱淋濁、帶下、癰腫、瘰疬、疥癬等；茯苓多用于水腫尿少、痰飲眩悸、脾虛食少、便溏泄瀉、心神不安、驚悸失眠等。

5.禁忌：土茯苓肝腎陰虛者慎服；茯苓陰虛而無濕熱、虛寒滑精、氣虛下陷者慎服。

在使用土茯苓和茯苓時，應根據自身的具體情況，在醫生的指導下合理用藥，以達到最佳的治療效果。