晚上睡覺時肛門疼痛可能是由肛裂、痔瘡、肛周膿腫、肛瘺、直腸炎等引起。

1. 肛裂：多因大便干結、排便用力過度等導致肛管皮膚全層裂開。睡覺時，肛門括約肌松弛，刺激裂口神經末梢，引發疼痛，常伴有便血，疼痛呈周期性，排便時疼痛劇烈，隨后緩解，之后又因括約肌痙攣再次疼痛。

2. 痔瘡：尤其是內痔脫出嵌頓或外痔發炎、血栓形成時。內痔脫出不能回納，會導致局部血液循環障礙，引起疼痛；外痔在受到摩擦、感染等情況下，會出現紅腫疼痛，睡覺時體位改變等可能加重疼痛癥狀。

3. 肛周膿腫：是肛門周圍軟組織發生的急性化膿性感染。膿腫形成后，局部壓力增高，炎癥刺激周圍神經，產生持續性疼痛，夜晚安靜狀態下，對疼痛更為敏感，疼痛會更明顯，還可能伴有發熱、墜脹等癥狀。

4. 肛瘺：多由肛周膿腫破潰后形成，外口反復流出膿性分泌物，刺激肛周皮膚，引發疼痛。睡覺時分泌物積聚，刺激加重，疼痛也會加劇，且常有肛周瘙癢等不適。

5. 直腸炎：炎癥刺激直腸黏膜，導致肛門墜脹、疼痛，尤其在夜間，腸道蠕動相對緩慢，炎癥滲出物積聚，刺激直腸和肛門神經，引起疼痛，還可能伴有腹瀉、便血等癥狀。

出現晚上睡覺時肛門疼痛的情況，要注意保持肛周清潔，避免久坐，飲食上多吃蔬菜、水果，保持大便通暢。若疼痛持續不緩解或加重，應及時就醫，明確病因，遵醫囑進行治療 。