可能有尿路感染的可能尿路結石在腎和膀胱內形成.上尿路結石與下尿路結石的形成機制、病因、結石成份和流行病學有顯著差異.上尿路結石大多數為草酸鈣結石.膀胱結石中磷酸鎂銨結石較上尿路多見.雖然部分腎結石有明確的原因，如甲狀旁腺機能亢進、腎小管酸中毒、海綿腎、痛風、異物、長期臥床、梗阻和感染等，但大多數鈣結石的形成原因目前仍不能完滿解釋.成核作用、結石基質和晶體抑制物質學說是結石形成的3種最基本學說.根據上尿路結石形成機制的不同，有人將其分為與代謝因素有關的結石和感染性結石.代謝性結石是由于代謝紊亂所致，如甲狀旁腺機能亢進，各種原因引起的高尿鈣癥、高尿酸尿癥和高草酸尿癥等.高濃度化學成份損害腎小管，使尿中基質物質增多，鹽類析出，形成結石.感染性結石是由于產生尿素酶的細菌分解尿液中的尿素而產生氨，使尿液堿化，尿中磷酸鹽及尿酸銨等處于相對過飽的狀態，發生沉積所致.細菌、感染產物及壞死組織亦為形成結石之核心