首先，它們的區別是兩種疾病的病原體是不同的，水痘是由水痘-帶狀皰疹病毒引起的，手足口是由病毒引起的。第二種是兩種疾病似乎并不相同，兩種疾病似乎是丘疹或皰疹性的，但其分布完全不同，水痘被稱為心臟的分布，但肢體和面部相對較小。根據名字，手足口才意識到它主要分布在手和腳和嘴部分，因此它們的分布有不同的區別。
      

      水痘和手足口病的區別很明顯。首先這兩種疾病感染的病原不一樣，水痘感染的是水痘帶狀皰疹病毒，而手足口病感染的柯薩奇病毒，它們產生損害的部位不一樣，手足口病一般出現手足口咽部和肛周的病毒疹，而水痘產生全身皮膚的水泡樣疹，不同階段的皰疹同時存在。在軀干部產生的丘疹隨著時間的推移會逐漸轉化為皰疹，最終形成水泡，而且泡壁比較薄，一般這種皮疹是呈向心性分布，四肢發生的相對較少，但頭面部出現的水痘皮膚損壞是非常常見的，手足口病所發生的皮膚損害主要在手掌和腳底部，軀干部和頭部發生的皮膚損害很少見，這兩種疾病所造成皮膚損害形態是不一樣的，水痘所造成的皮膚損害是呈水泡狀，手足口病所造成的皮膚損害是成炎性丘疹或者是皰疹，也有可能是紅色出血斑點，水痘所造成的皮膚損害，一般沒有明顯的疼痛，只是瘙癢癥狀比較明顯。