在急性期，可累及神經系統。少數病例除了手足口病的臨床表現外，可發生無菌性腦膜炎、腦炎、腦干腦炎、脊髓炎等。對于這樣的患者，應該從以下幾個方面進行治療：控制顱內高壓，限制患者的入量，記錄好出入量；積極給予甘露醇降顱壓治療，每次0.5～1.0g/kg，每4~8小時一次，在20～30分鐘內快速靜脈滴注完畢；必要時加用呋塞米，利尿治療；酌情應用糖皮質激素治療，參考的劑量為：甲潑尼龍1～2mg/(kg·d)，氫化可的松3～5mg/(kg·d)，地塞米松0.2～0.5mg/(kg·d)，病情穩定之后，遵醫囑減量或者停用；酌情應用靜脈注射免疫球蛋白治療。在急性期，患者可出現血流動力學改變。對于這樣的患者，應該應用擴血管藥物如米力農，維持量從0.25μg/（kg·min）起始，逐步調整劑量，最大可達1μg/（kg·min），用藥一般不超過72h。及時醫院就診。