多數(shù)多瘤病毒感染者無明顯癥狀，像皰疹病毒一樣，多瘤病毒亦呈潛伏狀態(tài)，直到有時(shí)（如損傷了免疫系統(tǒng)）引起它的激活。因此，本病常在初次感染后多年才發(fā)病。起病可漸起或突發(fā)，一旦發(fā)病則癥狀迅速惡化。其臨床表現(xiàn)隨感染腦組織的部位而變化。偏癱很常見，頭痛及癲癇則罕有發(fā)生。2/3以上的病人表現(xiàn)進(jìn)行性的智力障礙（癡呆）。也可出現(xiàn)部分失明和發(fā)音困難。在癥狀開始后1～6個(gè)月內(nèi)，死亡十分常見。但仍有部分病人存活。醫(yī)生可根據(jù)進(jìn)行性惡化的癥狀而作出診斷。無創(chuàng)性診斷技術(shù)如計(jì)算機(jī)斷層掃描和磁共振成像均有助于診斷。然而，患者生前很難作出確定診斷，直到死后才能獲得腦組織進(jìn)行確診檢查。