頸肩痛在治療過程中通常視具體病情和治療情況而定是否會留下后遺癥。若病情較輕且治療及時得當，一般不會留下明顯后遺癥；但若是病情嚴重、治療不規范或延誤治療，則可能出現一些不良后果。

頸肩痛的產生多與長期不良姿勢、勞損、外傷等因素有關。當頸部和肩部的肌肉、骨骼、神經等組織受到損傷或發生病變時，就會引發疼痛。在治療方面，常見的有物理治療、藥物治療、手術治療等方式。

對于病情較輕的頸肩痛患者，通過改善姿勢、適當休息以及物理治療，如熱敷、按摩、針灸等，往往能有效緩解疼痛，恢復正常功能，基本不會留下后遺癥。若頸肩痛是由嚴重的頸椎間盤突出、肩部骨折等疾病引起，且未得到及時有效的治療，可能會導致神經損傷、肌肉萎縮、關節僵硬等后遺癥，影響頸部和肩部的正常活動。

在日常生活中，應注意保持良好的姿勢，避免長時間低頭或保持同一姿勢，工作間隙適當活動頸肩部。進行適度的體育鍛煉，增強頸肩部肌肉力量。若出現頸肩痛癥狀，需及時就醫，遵循醫生的治療建議，以降低留下后遺癥的風險。