生殖器皰疹和梅毒在病原體、傳播途徑、臨床表現、實驗室檢查、治療方法等方面存在區別。

1. 病原體：生殖器皰疹由單純皰疹病毒HSV引起，主要為 HSV-2 型；梅毒由梅毒螺旋體感染所致。

2. 傳播途徑：生殖器皰疹主要通過性接觸傳播，也可通過母嬰傳播；梅毒主要通過性接觸傳播、母嬰傳播以及血液傳播。

3. 臨床表現：生殖器皰疹表現為簇集或散在的小水皰，常見于外生殖器、肛周等部位，2～4 天后破潰形成糜爛或潰瘍，自覺疼痛，常伴有腹股溝淋巴結腫痛、發熱、頭痛等全身癥狀，易復發；梅毒一期主要表現為硬下疳，為無痛性炎性硬結，表面發生壞死形成單個直徑為 1～2cm、圓形或橢圓形的無痛性潰瘍，邊界清楚，周邊水腫并隆起，基底呈肉紅色，觸之有軟骨樣硬度，二期梅毒可出現皮膚黏膜損害及骨關節、眼、神經等多系統損害，三期梅毒可侵犯心血管、神經等重要臟器。

4. 實驗室檢查：生殖器皰疹可通過病毒培養、核酸檢測等方法確診；梅毒常用的實驗室檢查方法有梅毒螺旋體暗視野顯微鏡檢查、非梅毒螺旋體抗原血清試驗、梅毒螺旋體抗原血清試驗等。

5. 治療方法：生殖器皰疹主要采用抗病毒藥物治療，如阿昔洛韋、伐昔洛韋等，以縮短病程、減輕癥狀、預防復發；梅毒治療首選青霉素，根據不同分期及病情選擇合適的劑型和療程。

日常要注意保持良好的個人衛生習慣，避免高危性行為，降低感染風險。若懷疑感染，應及時就醫檢查，確診后嚴格遵醫囑規范治療，治療期間避免性生活，定期復查，確保徹底治愈。