自費疫苗和免費疫苗在管理政策、預防疾病種類、費用承擔、接種原則以及疫苗來源等方面有所不同。

1.管理政策：自費疫苗是公民自愿自費接種的疫苗；免費疫苗是政府免費向公民提供，公民應當依照政府的規定受種的疫苗。

2.預防疾病種類：免費疫苗主要預防一些傳染性較強、流行面較廣、危害較大的疾病；自費疫苗則可預防更多種類的疾病，包括一些不太常見或特定人群易感染的疾病。

3.費用承擔：自費疫苗的費用由受種者自行承擔；免費疫苗的費用由政府承擔。

4.接種原則：自費疫苗是自愿選擇接種；免費疫苗則是按照國家規定的免疫程序進行接種。

5.疫苗來源：兩者的疫苗來源都是經過國家嚴格檢驗和審批的，但自費疫苗的種類相對更多樣化。

在接種疫苗時，應根據自身情況和醫生的建議，合理選擇自費疫苗和免費疫苗，以達到更好的預防疾病的效果。同時，接種后要注意觀察身體反應，如有異常應及時就醫。