免費疫苗和自費疫苗在費用承擔、納入規劃、預防疾病、接種建議、研發與供應等方面存在區別。

1.費用承擔：免費疫苗由政府承擔費用，公民免費接種；自費疫苗則需要個人自行承擔費用。

2.納入規劃：免費疫苗是國家免疫規劃中的一部分，具有強制性和普遍性；自費疫苗未納入國家免疫規劃，可根據個人需求和情況選擇接種。

3.預防疾病：免費疫苗主要針對一些常見、危害較大的傳染病；自費疫苗則涵蓋了更多種類的疾病，包括一些特定人群或特定情況下可能需要預防的疾病。

4.接種建議，包括免費疫苗的接種通常按照國家規定的免疫程序進行；自費疫苗的接種則可根據個人的健康狀況、生活環境、旅行計劃等因素來決定。

5.研發與供應：免費疫苗的研發和供應由國家統一組織和管理；自費疫苗的研發和供應則由市場機制調節，不同廠家的產品可能存在差異。

無論是接種免費疫苗還是自費疫苗，接種后都應在接種場所觀察一段時間，注意休息，保持接種部位的清潔，避免劇烈運動。如果出現不良反應，應及時就醫。