叢集性頭痛和三叉神經痛可以通過疼痛部位、疼痛時間、疼痛頻率、顱腦CT檢查、核磁共振檢查等方法鑒別和診斷，建議在醫生的指導下，通過綜合判斷才能準確診斷病情。

1.疼痛部位：叢集性頭痛和三叉神經痛都屬于比較常見的神經系統疾病，可能是不良生活習慣和神經系統受到感染等原因引起，可能會影響到正常的神經功能。叢集性頭痛三叉神經痛是有區別的，在做診斷鑒別時可以通過疼痛部位判斷，叢集性頭痛一般會出現在眼眶周圍，會出現周圍組織有疼痛癥狀。三叉神經痛的疼痛范圍通常會比較大，主要表現有太陽穴部位、面頰部位、口角部位等。

2.疼痛時間：叢集性頭痛在發作時通常會在晚上，在晚上時人體會處于靜止狀態，在這段時間身體也會比較敏感，通常會在每天同一時刻出現有不同程度的疼痛癥狀。三叉神經痛在發病時通常是沒有規律，可能會出現在一天當中的任何時間段，在發病時疼痛的時間會比較短，呈現出刀割樣疼痛以及電擊樣疼痛。

3.疼痛頻率：想判斷叢集性頭痛和三叉神經痛也可以通過疼痛頻率進行判斷，出現單獨一個部位疼痛或者疼痛時間比較短，可以判斷為叢集性頭痛。在出現頻繁的疼痛以及多個部位疼痛時，可以判斷為三叉神經痛。

4.顱腦CT檢查：是一種比較常見的影像學檢查方法，主要是通過放射線掃描判斷神經損傷的部位和嚴重程度，也可以準確判斷出叢集性頭痛和三叉神經痛。

5.核磁共振檢查：主要是通過磁場掃描進行診斷，在做檢查時清晰度比較高，可以判斷頭痛的原因和嚴重程度。

在做檢查時需要選擇正規醫院的神經內科，才可以提高檢查結果準確性，檢查時需要將身上攜帶電子產品和金屬制品去除。