綠飛秒和全飛秒在手術原理、切口大小、角膜穩定性、手術時間、恢復時間等方面存在不同。
1. 手術原理：綠飛秒即半飛秒，全稱是飛秒激光制瓣準分子原位角膜磨鑲術，先用飛秒激光制作角膜瓣，掀開角膜瓣后，再用準分子激光對角膜基質層進行切削，以改變角膜曲率矯正視力。全飛秒全稱全飛秒激光微小切口基質透鏡切除術，直接用飛秒激光在角膜基質層內制作一個透鏡，然后通過微小切口將透鏡取出，改變角膜屈光狀態。
2. 切口大小：綠飛秒手術切口較大，一般在20-24毫米。全飛秒手術切口微小，僅2-4毫米，是目前切口最小的近視手術方式。
3. 角膜穩定性：綠飛秒由于制作的角膜瓣切斷了角膜表面的神經纖維，在術后早期角膜瓣的貼合需要一定時間，相對而言角膜穩定性在短期內略遜一籌。全飛秒沒有制作角膜瓣，對角膜表面神經纖維的損傷較小，角膜生物力學穩定性更好。
4. 手術時間：綠飛秒手術過程相對復雜一些，手術時間通常在10-15分鐘。全飛秒手術操作相對簡單，手術時間一般在5-10分鐘。
5. 恢復時間：綠飛秒術后視力恢復較快，但角膜瓣完全愈合需要一定時間，在此期間需注意避免外力碰撞眼睛。全飛秒術后視力恢復也較快，角膜切口小，恢復相對更快一些，干眼等不適癥狀通常也較輕且持續時間短。
近視手術后要注意保護眼睛，避免長時間用眼，防止眼疲勞。術后初期避免臟水入眼，防止眼部感染。外出可佩戴太陽鏡，減少強光刺激。按照醫生要求定期復查，以便及時了解眼部恢復情況，嚴格遵醫囑使用眼藥水。
