硝呋太爾通常不會破壞陰道菌群。硝呋太爾對導致陰道炎的細菌、滴蟲和念珠菌有較強抑制作用，且對陰道內的乳酸桿菌等有益菌影響較小，一般能在治療炎癥的同時維持陰道微生態平衡。

硝呋太爾是一種常見的抗感染藥物。在治療陰道炎癥時，其作用機制是通過抑制病原體的代謝過程，從而達到消滅病原體的目的。與一些其他抗生素不同，它具有相對較高的選擇性，主要針對有害病原體發揮作用，而對陰道內正常的有益菌群影響不大。

陰道內存在著多種微生物，乳酸桿菌是其中重要的有益菌，能夠維持陰道的酸性環境，抑制有害菌的生長。硝呋太爾在發揮治療作用的過程中，不會大量殺滅乳酸桿菌等有益菌，使得陰道的自凈功能得以保持。這對于預防炎癥的復發和維持陰道的健康狀態至關重要。

在使用硝呋太爾治療相關疾病時，應嚴格按照醫生的建議進行。要注意用藥的劑量、療程等。同時，保持良好的個人衛生習慣，如勤換內褲、注意外陰清潔等，有助于提高治療效果，維護陰道的健康微生態。