胃腸間質瘤的治療方法主要有靶向治療、免疫治療、化療、放療、手術治療等。
1. 靶向治療：胃腸間質瘤的發生發展與特定的基因突變相關，靶向治療藥物能精準作用于這些靶點。像甲磺酸伊馬替尼膠囊，可抑制腫瘤細胞的酪氨酸激酶活性，阻礙其增殖；蘋果酸舒尼替尼膠囊，能阻斷多種生長因子受體，抑制腫瘤血管生成；瑞戈非尼片，可抑制多個靶點，抑制腫瘤生長和轉移，遵醫囑用藥能有效控制胃腸間質瘤進展。
2. 免疫治療：人體免疫系統可識別和清除腫瘤細胞，但胃腸間質瘤細胞會有免疫逃逸機制。免疫治療藥物能激活自身免疫系統，增強免疫細胞對胃腸間質瘤細胞的識別和殺傷能力，通過調節免疫微環境，打破腫瘤的免疫逃逸，達到治療目的。
3. 化療：化療藥物能通過血液循環到達全身，殺死胃腸間質瘤細胞。常用的化療藥物可干擾腫瘤細胞的DNA合成、轉錄或蛋白質合成等過程，阻止其分裂和增殖，從而控制腫瘤的生長和擴散，不過化療也會對正常細胞有一定損傷，需遵醫囑使用。
4. 放療：利用高能射線對胃腸間質瘤部位進行照射，射線能量可破壞腫瘤細胞的DNA結構，使其無法正常分裂和增殖，進而殺死腫瘤細胞，控制腫瘤大小，緩解癥狀，尤其適用于無法手術或手術后局部復發的患者。
5. 手術治療：對于早期胃腸間質瘤，手術切除腫瘤組織是最直接有效的方法。通過完整切除腫瘤，可去除病灶，達到根治目的。若腫瘤沒有發生轉移，手術切除后患者的預后較好。但手術存在一定風險，需綜合評估患者身體狀況等因素后進行。
胃腸間質瘤患者治療后要保持健康的生活方式，規律作息，避免熬夜，飲食上多吃清淡易消化食物，避免刺激性食物。定期復查，嚴格按照醫生囑咐進行后續治療和康復，出現不適及時就醫。
