寶寶早上總咳嗽可能是由呼吸道干燥、過敏、呼吸道感染、胃食管反流、先天性喉軟骨發育不良等原因引起。

1. 呼吸道干燥：夜間睡眠時，室內空氣若比較干燥，會使寶寶呼吸道黏膜缺水，變得脆弱。早上醒來，呼吸道受到刺激，就容易引發咳嗽，以幫助清除呼吸道內的干燥分泌物。

2. 過敏：寶寶如果對塵螨、動物毛發皮屑等過敏，夜間睡眠時接觸到這些過敏原，呼吸道會出現過敏反應，導致氣道痙攣、分泌物增多，早上就會出現咳嗽癥狀。

3. 呼吸道感染：像感冒、支氣管炎等呼吸道感染疾病，炎癥會使呼吸道黏膜充血、水腫，產生分泌物。經過一夜的積攢，早上這些分泌物刺激呼吸道，引起咳嗽。

4. 胃食管反流：寶寶的食管下括約肌發育不完善，睡覺時平躺的姿勢容易使胃內容物反流至食管，刺激咽喉，早上就可能出現咳嗽，通常還伴有吐奶、溢奶等情況。

5. 先天性喉軟骨發育不良：部分寶寶存在先天性喉軟骨發育不良的問題，喉部組織軟弱松弛，吸氣時組織塌陷、喉腔變小，氣流通過受阻，早上也會出現咳嗽，且一般在出生后不久就有癥狀。

日常生活中，要保持室內空氣濕潤，定期清潔寶寶的生活環境，減少過敏原。注意寶寶的喂養姿勢，避免過度喂養。若寶寶咳嗽持續不緩解或伴有發熱、呼吸急促等異常，應及時就醫，在醫生的指導下進行診斷和治療 。