磁共振是影像學檢查，主要用于檢查機體組織器官的異常形態變化，從而作出明確的診斷。核磁共振可以檢查出腦炎。腦炎可以是病毒性、細菌性、真菌性、結核性、自身免疫性腦炎。
      

      腦炎做磁共振是能查出來的。特別是對診斷早期感染性腦膜炎具有重要應用價值。檢查腦炎，首選腦脊液化驗可以確診，另外腦電圖也可以作為無損傷性的檢查，有些醫院僅根據孩子有頭痛，嘔吐，腦電圖異常就診斷腦炎，但如果沒有腰穿腦脊液的支持，其實依據并不充分。