由于目前沒有特效的抗病毒藥物，尖銳濕疣的治療必須采用綜合治療。（一）治療誘因（二）提高機體免疫力。（三）應用抗病藥物。一般只要堅持規則的綜合治療都可治愈。1．手術療法對于單發、面積小的濕疣，可手術切除；對巨大尖銳濕疣，可用Mohs氏手術切除，手術時用冷凍切片檢查損害是否切除干凈。2．冷凍療法3．激光治療4．電灼治療5．微波治療6．藥物療法（1）足葉草脂：本療法適用濕潤區域的濕疣，例如發生于包皮過長而未曾作包皮環切除手術的龜頭及會陰部的濕疣。但對宮頸尖銳濕疣不能用足葉草脂治療。用20%足葉草脂酊劑涂到皮損處或用藥前，先有油質抗菌藥膏保護皮損周圍的正常皮膚或粘膜，然后涂藥，用后4-6小時，用30%硼酸水或肥皂水清洗，必要時3天后重復用藥，該藥是國外用于本病治療的首先藥，一般用一次可愈。但有很多缺點，如對組織破壞性大，使用不當可引起局部潰瘍。毒性大，主要表現為惡心、腸梗阻、白細胞及血小板減少，心動過速、尿閉或少尿，故使用時必須謹慎，發現上述反應時，應立即停藥。（2）抗病毒藥：可用5%酞丁胺霜劑，或用0.25%皰疹凈軟膏，每日2次，外涂。無環鳥苷口服，每日5次，每次200mg，或用其軟膏外用，α-干擾素每日注射300萬單位,每周用藥五天。或干擾素300萬單位注入疣體基部，每周2次。連用2-3周，主要副作用為流感樣綜合癥，局部用藥副作用較少且輕微。（3）腐蝕劑或消毒劑：常用有30%-50%三氯醋酸或飽和二氯醋酸，或18%過氧乙酸。用10%水楊酸冰醋酸或40%甲醛、2%液化酚、75%乙醇蒸餾水100ml混合溶液，點涂局部，用于龜頭、肛周濕疣，每日或隔日一次，效果甚好。消毒劑可用20%碘酊外涂，或2.5-5%碘酊注射于疣體基部，每次0.1-1.5ml，或用新潔爾滅外涂或以0.1-0.2%外敷，后者需配合全身療法。7．免疫療法①自體疫苗法②干擾素誘導劑：可用聚肌胞及梯洛龍。聚肌胞每日注射2ml，連用10天，停藥1-2月后，再繼續用藥。梯洛龍每日3次，每次300mg，停藥4天，或隔日口服600mg。③干擾素、白介Ⅱ，靈桿菌素，利百多聯合應用，療效較佳。