蛔蟲轉移到眼球可引起失明，移行到肝臟可引起肝腫大，誤入到腦、腎甲狀腺等處可引起腦膜炎、癲癇、尿不正常或相應臟器的炎癥。如果短期內吃下大量有傳染性的蟲卵，當它們蛻皮成為幼蟲時，到達肺部可引起蛔蟲性嗜酸性肺炎。成蟲定居在腸道內，由于蟲體本身對腸道的機械刺激以及它所分泌的毒素和代謝產物，可以引起消化道功能紊亂，如腹痛、食欲不好、腹瀉等。一旦發熱或發生嘔吐時可以嘔出蛔蟲。蛔蟲亦可從鼻孔或肛門爬出來或隨大便一起排出。蛔蟲感染嚴重時，可以使兒童發生營養不良、智力遲鈍和發育落后，有時表現為煩躁不安、易怒、失眠、磨牙，甚至驚厥等，嚴重影響兒童的身體健康和生長發育，有時還可以引起過敏反應（如頑固的蕁麻疹等）。蛔蟲有愛鉆孔的習性，當蛔蟲受到各種刺激及（如高熱、消化不良、驅蟲不當等）時，就會發動騷動，引起蛔蟲病的合并癥。最常見的是膽道蛔蟲，蛔蟲鉆入膽道內，發作起來一陣陣有上腹部劇烈絞痛，使患者哭叫、打滾、出冷汗。其次也可以發生蛔蟲性闌尾炎，突然發作腹痛，以后漸漸轉到右下腹絞痛，在疼痛緩解時，在闌尾處有時可摸到蛔蟲的條索。如繼續發展可使闌尾壞死、穿孔而形成蛔蟲性腹膜炎。蛔蟲集結成團，可以堵塞腸管造成蛔蟲性腸梗阻，如不及時有效的治療，也可以發生腸壞死和腹膜炎。