據文獻資料報到鹽酸帕羅西汀臨床對照研究觀察到的主要不良反應為中樞神經系統：嗜睡、失眠、激動、震顫、焦慮、頭暈；胃腸道系統包括便秘、惡心、腹瀉、口干、嘔吐和胃腸脹氣；其他還有乏力、性功能障礙(包括陽痿、性欲下降)。多數不良反應的強度和頻率隨用藥的時間而降低,通常不影響治療。曾有不安、幻覺、輕躁狂、紅-綠色盲、嘔吐及血清素綜合征的報道。與其它5-羥色胺再攝取抑制劑一樣,有報道服用本品造成短暫的血壓改變,此情況多發生于有潛在高血壓或焦慮患者,但少有心動過速的報道。曾有發生意識障礙的報道。也有報道肝功能異常,但少有嚴重的肝功能異常,若肝功能檢查持續升高應考慮停服本片,還有報道異常出血(多為瘀血和紫癜),也有血小板減少癥的少量報道。也有報道迅速停藥而引起的綜合癥狀(如頭暈、感覺障礙、睡眠障礙、激惹、震顫、惡心、出汗、社交恐怖癥/焦慮癥、意識模糊)。建議終止治療前逐漸減量。